Non-GMO 표시제는 GMO 표시 대상 품목 중 GMO 원료를 사용하지 않았음을 자율적으로 표시하는 제도이다. 보통 비유전자변형식품(Non-GMO) 또는 GMO-free 등으로 표기되며, 식품의약품안전처(식약처)의 「유전자변형식품등의 표시기준」에 따라 특정 요건을 만족할 경우 ‘Non-GMO’ 표시를 할 수 있다. 현행 규정상 Non-GMO 표시를 하려면 비의도적 혼입치가 0%, GMO의 불검출이어야 한다.
Non-GMO 표시제는 GMO를 피하고 싶은 소비자에게는 적합할 수 있으나 이러한 표시가 마치 GMO 제품이 유해하거나 위험할 수 있다는 근거 없는 불안감을 소비자에게 심어줄 수 있다는 우려가 존재한다. 또한 재배, 수확, 운송 과정에서 비의도적으로라도 소량의 GMO가 섞이는 것을 막기 어려워 현실성이 부족한 규정이라는 비판과 함께, 쌀이나 밀 등 GMO 형태로 수입이 되지 않는 농산품목에도 오해와 혼란을 줄 수 있다는 의견이 존재한다.
